lily951 发表于 2024-9-2 14:33:09

片段分析原理

片段分析(Fragment Analysis, FA)的原理主要基于分子生物学技术,特别是针对由PCR(聚合酶链式反应)过程所产生的DNA或cDNA片段进行分析。这些片段的大小或标记荧光的差异是分析的关键点,广泛应用于医学、环境、农业研究等领域的基因型分型、DNA指纹分析、突变检测等。以下详细阐述片段分析的原理:1. 技术基础
[*]PCR扩增:首先,从生物样本(如组织、血液、痰液)中提取核酸(DNA或RNA),制备成模板和引物,进行多重PCR扩增。这一步的目的是产生大量的目标DNA片段。
[*]荧光标记:在PCR过程中,使用荧光标记的引物进行扩增,使得PCR产物带有荧光标记。不同大小的片段可以采用不同颜色的荧光进行标记,以便于后续分析。
2. 分离与分析
[*]电泳分离:扩增后的荧光标记DNA片段通过电泳技术进行分离。电泳方法包括凝胶电泳(如琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳)、高效液相色谱法(HPLC)、变性高效液相色谱分析(DHPLC)以及毛细管电泳等。
[*]琼脂糖凝胶电泳:利用琼脂糖作为支持介质,通过电场作用使DNA片段根据大小和构型进行分离。
[*]聚丙烯酰胺凝胶电泳:分辨率极高,适合分离小片段DNA(5-500bp)。
[*]HPLC与DHPLC:以液体为流动相,通过高压输液系统实现DNA片段的分离和检测,DHPLC特别适用于基因突变筛查。
[*]毛细管电泳:高效、快速、微量,是片段分析中较为先进的技术之一,广泛应用于先进片段分析(AFA)。

[*]荧光检测:在电泳过程中,利用荧光检测器对带有荧光标记的DNA片段进行识别和区分。
3. 数据分析
[*]软件分析:通过专门的软件对电泳结果进行分析,确定DNA片段的大小和基因型。
[*]大小分析:软件利用标准曲线和荧光标记片段的比较,确定片段的相对大小。
[*]基因型分析:根据用户自定义的基因位点来分配等位基因,从而确定基因型。

4. 先进片段分析(AFA)AFA是片段分析中较为领先的技术,其核心内容包括多重PCR技术和毛细电泳系统分离。在同一个PCR反应体系中包含多对引物,各引物特异性地结合相应的目的基因进行多重PCR;通过毛细管电泳系统可对不同片段长度的PCR产物进行分离和识别,同时根据峰面积的大小还可对不同产物进行定量分析。AFA能够同时分析多个SNP位点或检测多个低拷贝数的病原体,大大提高了分析效率和准确性。

basanling 发表于 2024-9-2 14:49:21

片段分析原理:基于PCR扩增的DNA片段,利用片段大小或标记荧光的差异,通过电泳或高效液相色谱等方法进行分析,应用于基因型分型、DNA指纹分析等领域。

xiaobaba 发表于 2024-9-2 16:12:50

非常专业的分析,作者对它的原理了解得如此深入,真是让人佩服!

zhouyiq 发表于 2024-9-3 16:05:47

楼上,太对了,简直就是我的心声!
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